Il 9 maggio si svolgono, rispettivamente alle ore 11,30 ed alle ore 17,00, la seconda e la terza votazione per le quali, come per la prima, è prevista la maggioranza dei due terzi dei 1.009 grandi elettori (quorum richiesto: 674 voti).

Il 10 maggio, alle ore 9,30, si svolge la quarta votazione: sufficiente la maggioranza assoluta, pari a 505 voti.
Giorgio Napolitano è eletto Presidente della Repubblica con 543 voti.

Il 15 maggio, alle ore 17, è convocato il Parlamento in seduta comune per il giuramento del nuovo Presidente della Repubblica.

Giuramento del Presidente della Repubblica Giorgio Napolitano davanti al Parlamento in seduta comune, suo insediamento nel Palazzo del Quirinale e congedo del Presidente Carlo Azeglio Ciampi - Roma, lunedì 15 maggio 2006
(Sintesi del programma)
Ore 16, 55 - Il Presidente della Repubblica Giorgio Napolitano giunge in Piazza Montecitorio. All'ingresso di Palazzo Montecitorio, il Presidente della Repubblica è ricevuto dal Presidente della Camera dei Deputati e dal Presidente del Senato della Repubblica.
Ore 17,00 - Il Presidente della Repubblica entra nell'Aula. Pronuncia la formula di giuramento e rivolge il messaggio alla Nazione.
Ore 18,00 - Il Presidente della Repubblica si reca all'Altare della Patria per la deposizione di una corona sulla tomba del Milite Ignoto.
Ore 18,15 - Il corteo presidenziale giunge al Palazzo del Quirinale. Nel Cortile d'Onore. Il Presidente della Repubblica Napolitano ascolta l'esecuzione dell'Inno Nazionale e passa in rassegna un reparto di formazione interforze che rende gli onori.
Al termine della rassegna il Presidente della Repubblica Napolitano viene accolto dal Presidente Ciampi.
Ore 18,40 - Il Capo dello Stato Napolitano e il Presidente Ciampi fanno ingresso nel Salone dei Corazzieri. Il Presidente Ciampi pronuncia un indirizzo di saluto al quale risponde il Presidente della Repubblica Napolitano.
Al termine, ha luogo il saluto delle personalità intervenute alla cerimonia.
Ore 19,20 - Il Presidente Ciampi discende con l'ascensore al piano terra della Vetrata.
Dopo aver ascoltato da fermo l'esecuzione dell'Inno Nazionale, il Presidente Ciampi passa in rassegna, accompagnato dal Consigliere Militare, un reparto di formazione interforze che rende gli onori.
Al termine dello schieramento, il Comandante del Reggimento Corazzieri consegna al Presidente Ciampi un esemplare dello Stendardo presidenziale.
Dopo aver preso congedo dal Segretario Generale della Presidenza della Repubblica e dai Collaboratori, il Presidente Ciampi lascia il Palazzo del Quirinale.

Il 16 maggio il Presidente della Repubblica inizia le consultazioni che si concludono con il conferimento dell'incarico per la formazione del nuovo esecutivo a Romano Prodi che accetta con riserva.

Il 17 maggio Romano Prodi presenta al Presidente della Repubblica la lista dei ministri che compongono il suo esecutivo.
I ministri di Istruzione e di Università e Ricerca sono, rispettivamente, Giuseppe Fioroni e Fabio Mussi.
Alle ore 16,30 il giuramento del nuovo esecutivo e, a seguire, il primo Consiglio dei ministri per la nomina dei sottosegretari.

Il 18 maggio si svolge la cerimonia del giuramento dei sottosegretari di Stato.
Di seguito Prodi presenta al Senato il suo programma per il voto di fiducia.

Il 19 maggio il Senato esprime la fiducia al Governo.

Il 22 maggio il Governo si presenta alla Camera per il voto di fiducia.

Il 23 maggio la Camera esprime la fiducia al Governo.

Camera

Senato

All’inizio dei lavori il Presidente Prodi ha rivolto un saluto particolare al Capo dello Stato ed ai Presidenti delle Camere, nonché l’augurio di un proficuo lavoro a tutti i Ministri. Ha poi formulato le seguenti proposte, che sono state collegialmente condivise dal Consiglio:
- nomina a Sottosegretario di Stato alla Presidenza del Consiglio dei Ministri dell’on. Enrico LETTA, con le funzioni di Segretario del Consiglio medesimo;
- attribuzione delle funzioni di Vicepresidente all’on Massimo D’ALEMA e all’on. Francesco RUTELLI;
- conferimento ai Ministri senza portafoglio dei seguenti incarichi:
1) all’on. Rosy BINDI le politiche per la famiglia;
2) all’on. Emma BONINO il commercio internazionale e le politiche europee;
3) all’on. Vannino CHITI i rapporti con il Parlamento e le riforme istituzionali;
4) all’on. Linda LANZILLOTTA gli affari regionali e le autonomie locali;
5) all’on. Giovanna MELANDRI le politiche giovanili e le attività sportive;
6) al prof. Luigi NICOLAIS le riforme e l’innovazione nella pubblica amministrazione;
7) all’on. Barbara POLLASTRINI i diritti e le pari opportunità;
8) all’on. Giulio SANTAGATA l’attuazione del programma di Governo;
- nomina dei Sottosegretari di Stato presso vari Dicasteri.
Il Presidente Prodi ha altresì conferito al Ministro dell’economia e delle finanze, prof. PADOA SCHIOPPA la delega a rappresentare il Governo presso l’OCSE. Ha esposto poi le linee generali delle dichiarazioni programmatiche che illustrerà alle Camere, i cui contenuti sono stati unanimamente condivisi dal Consiglio.
Il Presidente del Consiglio ha informato il Consiglio dei Ministri di aver nominato il prof. avv. Carlo MALINCONICO Segretario generale della Presidenza del Consiglio.
Infine, su proposta del Presidente Prodi, il Consiglio ha approvato un decreto-legge che provvede ad un riordino delle attribuzioni della Presidenza del Consiglio dei Ministri e di alcuni Ministeri per rafforzare l’azione di governo e renderla più funzionale alla realizzazione del Programma.
In particolare, lasciando sostanzialmente invariato il numero dei Ministeri, che ora sono 25, si è realizzata una diversa articolazione delle responsabilità ministeriali.
E’ di nuova configurazione il Ministero dello sviluppo economico che somma le competenze del Ministero delle attività produttive e quelle del Dipartimento per le politiche di sviluppo e coesione del Ministero dell’economia e delle finanze e il Ministero della solidarietà sociale al quale sono attribuite le funzioni in materia di politiche sociali e tutela delle fasce deboli ed emarginate, di politiche antidroga e quelle sui flussi dei lavoratori extracomunitari.
Sono stati invece riorganizzati in autonomi Ministeri le funzioni in materia di:
- infrastrutture;
- trasporti;
- commercio internazionale;
- istruzione,
- università e ricerca.
La seduta ha avuto termine alle ore 23.55.

(...) Il Presidente Berlusconi ha riferito al Consiglio dei Ministri che il nuovo Presidente della Repubblica eletto, Giorgio Napolitano, ha espresso l’intendimento di nominare il consigliere di Stato dott. Donato Marra Segretario generale della Presidenza della Repubblica. Il Consiglio ha espresso avviso favorevole.
La riunione ha avuto termine alle ore 12,45.

Il Consiglio dei Ministri si riunisce alle ore 12,50 a Palazzo Chigi.
Alle ore 13,10 il capo del Governo, conclusosi il Consiglio dei Ministri, rassegna le proprie dimissioni al Presidente della Repubblica